Annotation of biobar/www/Databases.html, revision 1.5

1.4       jawahar     1: <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
                      2: <html>
                      3: <head>
                      4: </head>
                      5: <body>
1.1       jawahar     6: <h3> Database currently included in biobar</h3>
1.4       jawahar     7: <p> biobar 1.2 provides browsing and searching access to the following
                      8: biological databases.<br>
                      9: </p>
1.5     ! jawahar    10: <table style="text-align: left; width: 988px; height: 312px;" border="3"
        !            11:  cellpadding="2" cellspacing="2">
1.4       jawahar    12:   <tbody>
                     13:     <tr>
1.5     ! jawahar    14:       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;">Data
        !            15: Collections</span><br>
1.4       jawahar    16:       </td>
                     17:       <td
1.5     ! jawahar    18:  style="vertical-align: top; background-color: rgb(255, 204, 204);">1.
        !            19: EBI Databases with SRS<br>
1.4       jawahar    20: 2. NCBI Databases<br>
                     21: 3. DNA Database of Japan(DDBj)<br>
                     22:       </td>
1.5     ! jawahar    23:       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;">Functional
        !            24: Databases</span><br>
1.4       jawahar    25:       </td>
                     26:       <td
                     27:  style="vertical-align: top; background-color: rgb(255, 204, 204);">
                     28:       <ol>
1.5     ! jawahar    29:         <li>Gene Ontology (GO)</li>
        !            30:         <li>IntAct</li>
        !            31:         <li>Reactome Database</li>
1.4       jawahar    32:       </ol>
                     33:       </td>
                     34:     </tr>
                     35:     <tr>
1.5     ! jawahar    36:       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;">Sequence
        !            37: Databases</span><br>
1.4       jawahar    38:       </td>
                     39:       <td
                     40:  style="vertical-align: top; background-color: rgb(255, 204, 204);">
                     41:       <ol>
                     42:         <li>EMBL Nucleotide Database</li>
                     43:         <li>Ensembl Genome Browser</li>
                     44:         <li>UniProt Sequence Database</li>
                     45:         <li>InterPro</li>
                     46:         <li>Integr8</li>
                     47:         <li>Expert Protein Analysis System (ExPASy)<br>
                     48:         </li>
                     49:       </ol>
                     50:       </td>
1.5     ! jawahar    51:       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;">Structural
        !            52: Databases</span><br>
1.4       jawahar    53:       </td>
                     54:       <td
1.5     ! jawahar    55:  style="vertical-align: top; background-color: rgb(255, 204, 204);">
1.4       jawahar    56:       <ol>
1.5     ! jawahar    57:         <li>Macromolecular Structure Database (MSD)</li>
        !            58:         <li>Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB)</li>
        !            59:         <li>Protein Data Bank Japan (PDBj)</li>
        !            60:         <li>Nucleic Acid Database (NDB)</li>
        !            61:         <li>Pfam</li>
        !            62:         <li>CATH</li>
        !            63:         <li>SCOP</li>
1.4       jawahar    64:       </ol>
                     65:       </td>
                     66:     </tr>
                     67:     <tr>
1.5     ! jawahar    68:       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;">Animal
        !            69: Databases</span><br>
1.4       jawahar    70:       </td>
                     71:       <td
                     72:  style="vertical-align: top; background-color: rgb(255, 204, 204);">
                     73:       <ol>
                     74:         <li>Saccharomyces Genome Database (SGD)<br>
                     75:         </li>
                     76:         <li>Flybase</li>
                     77:         <li>Wormbase</li>
                     78:         <li>Rat Genome Database (RGD)<br>
                     79:         </li>
                     80:         <li>Mouse Genome Informatics (MGI)</li>
                     81:       </ol>
                     82:       </td>
1.5     ! jawahar    83:       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;">Plant
        !            84: Databases</span><br>
1.4       jawahar    85:       </td>
                     86:       <td
1.5     ! jawahar    87:  style="vertical-align: top; background-color: rgb(255, 204, 204);">
1.4       jawahar    88:       <ol>
                     89:         <li>Gramene</li>
                     90:         <li>MaizeGDB<br>
                     91:         </li>
                     92:       </ol>
                     93:       </td>
                     94:     </tr>
                     95:   </tbody>
                     96: </table>
                     97: <p><br>
                     98: </p>
1.1       jawahar    99: <br>
1.4       jawahar   100: </body>
                    101: </html>

FreeBSD-CVSweb <freebsd-cvsweb@FreeBSD.org>