Annotation of biobar/www/Databases.html, revision 1.2

1.1       jawahar     1: 
                      2: <h3> Database currently included in biobar</h3>
                      3: <p> biobar 1.2 (release candidate) currently provides browsing and searching access to the following biological databases.</p>
                      4: <table style="text-align: left; width: 672px; height: 622px;" border="1"
                      5: cellpadding="2" cellspacing="2">
                      6: <tbody>
                      7: <tr>
                      8: <td style="vertical-align: top;"><br>
                      9: Data Collections <br>
                     10: </td>
                     11: <td style="vertical-align: top;">
                     12: <ol>
                     13: <li>EBI Databases with SRS</li>
                     14: <li>NCBI Databases including PubMed</li>
                     15: <li>DNA Data Bank of Japan (DDBJ)</li>
                     16: </ol>
                     17: </td>
                     18: </tr>
                     19: <tr>
                     20: <td style="vertical-align: top;"><br>
                     21: <br>
                     22: <br>
                     23: Structural Databases
                     24: </td>
                     25: <td style="vertical-align: top;">
                     26: <ul>
                     27: </ul>
                     28: <ol>
                     29: <li>Macromolecular Structure Database (MSD)</li>
                     30: <li>Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB)</li>
                     31: <li>Protein Data Bank, Japan</li>
1.2     ! jawahar    32: <li>Nucleic Acids Database</li>
1.1       jawahar    33: <li>Pfam</li>
                     34: <li>CATH</li>
                     35: <li>SCOP</li>
                     36: </ol>
                     37: </td>
                     38: </tr>
                     39: <tr>
                     40: <td style="vertical-align: top;"><br>
                     41: <br>
                     42: <br>
                     43: Sequence Databases
                     44: </td>
                     45: <td style="vertical-align: top;">
                     46: <ul>
                     47: </ul>
                     48: <ol>
                     49: <li>EMBL Nucleotide Database</li>
                     50: <li>Ensembl Genome Browser</li>
                     51: <li>UniProt Sequence Database</li>
                     52: <li>InterPro</li>
                     53: <li>Integr8</li>
                     54: <li>Expert Protein Analysis System (ExPASy)</li>
                     55: </ol>
                     56: </td>
                     57: </tr>
                     58: <tr>
                     59: <td style="vertical-align: top;">Functional Databases<br>
                     60: </td>
                     61: <td style="vertical-align: top;">
                     62: <ul>
                     63: </ul>
                     64: <ol>
                     65: <li>Gene Ontology (GO)</li>
                     66: <li>IntAct</li>
                     67: <li>Reactome Database</li>
                     68: </ol>
                     69: </td>
                     70: </tr>
                     71: <tr>
                     72: <td style="vertical-align: top;">Plant Databases<br>
                     73: </td>
                     74: <td style="vertical-align: top;">
                     75: <ul>
                     76: </ul>
                     77: <ol>
                     78: <li>Gramene</li>
                     79: <li>MaizeGDB</li>
                     80: </ol>
                     81: </td>
                     82: </tr>
                     83: <tr>
                     84: <td style="vertical-align: top;">Animal Databases<br>
                     85: </td>
                     86: <td style="vertical-align: top;">
                     87: <ol>
                     88: <li>Saccharomyces Genome Database (SGD)<br>
                     89: </li>
                     90: <li>Flybase</li>
                     91: <li>Wormbase</li>
                     92: <li>Rat Genome Database (RGD)<br>
                     93: </li>
                     94: <li>Mouse Genome Informatics (MGI)<br>
                     95: </li>
                     96: </ol>
                     97: </td>
                     98: </tr>
                     99: </tbody>
                    100: </table>

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